小非编码RNA(sncRNA),包括miRNA、tsRNA、rsRNA和ysRNA,是重要的调节分子。急性髓细胞白血病(AML)具有异质性,并涉及多种非编码RNA改变。近年来,miRNA在AML中的作用已被广泛探索,miRNA的明确表达谱已在白血病中得到区分。


(相关资料图)

由于环状miRNA具有敏感性、稳定性和非侵袭性等吸引人的优势,许多研究表明,环状miRNA可以作为一类新型的非侵入性诊断和预后生物标志物,在多种癌症中具有良好的临床应用前景。然而,这些研究大多集中在miRNA上,很少对血清中其他类型的环状sncRNA进行研究。

图片来源:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36923527/

近日,来自陆军军医大学的研究者们在Theranostics.杂志上发表了题为“Human circulating small non-coding RNA signature as a non-invasive biomarker in clinical diagnosis of acute myeloid leukaemia”的文章,该研究全面表征了血液和骨髓中环状sncRNA的表达模式及其在健康对照组和急性髓细胞白血病(AML)患者之间的改变特征。该研究丰富了sncRNA在AML调节中的研究,并为sncRNAs在AML中的作用提供了见解。

AML是成年人中最常见的急性白血病,它是高度异质性的,涉及多种组学水平的异常。体液中存在的小的非编码RNA(sncRNA)是重要的调节分子,被认为是有前途的非侵入性疾病临床诊断生物标志物。然而,AML患者血清和骨髓上清液中sncRNA谱改变的特征仍在探索中。

研究者检查了80名连续新诊断的AML患者和12名健康对照的血液和骨髓样本数据,以进行高通量小RNA测序。对差异表达的sncRNA进行分析,以揭示AML患者和对照组之间的不同模式。使用机器学习方法来评估特异性sncRNA在区分AML患者和对照组方面的效率。通过RT-PCR、Q-PCR和northern印迹评估个体sncRNA表达水平的改变。采用相关性分析来评估血清和骨髓上清液之间的sncRNA模式。

研究者在血清和骨髓上清液中发现了20多种不同于miRNA的sncRNA类别,它们之间具有高度协调的表达模式。非经典sncRNA,包括rsRNA(62.86%)、ysRNA(14.97%)和tsRNA(4.22%),在AML患者的血清sncRNA中占主导地位,并显示出敏感的改变模式。该数据还表明,血清tsRNA与AML预后密切相关,这表明血清tsRNA作为生物标志物在AML诊断中的潜在应用。

tsRNA在健康人PBS中的表达模式

图片来源:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36923527/

综上所述,该研究提供了健康对照组和AML患者中人类环状sncRNA及其改变特征的全面表征,为未来的生物学研究提供了独特的资源,可能有助于识别与白血病生物学、预后和耐药性有关的新的关键sncRNA。(生物谷 Bioon.com)

参考文献

Lin Xia et al. Human circulating small non-coding RNA signature as a non-invasive biomarker in clinical diagnosis of acute myeloid leukaemia. Theranostics. 2023 Feb 13;13(4):1289-1301. doi: 10.7150/thno.80054.

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